手游分系统的主要原因包括以下几点：

利益分配

苹果对iOS平台的应用会抽取30%的收益，而安卓平台则只抽取70%。这使得游戏开发者在iOS和安卓平台上需要采取不同的盈利策略，分开运营可以让他们从两个平台分别获得收入，尽管这最终损害了消费者的利益。

应用审核机制

苹果对游戏更新的补丁包审核非常严格，审核时间较长，而安卓平台则可以直接向用户推送更新。如果两个系统不分开，将会导致数据混乱和管理困难。

用户数据互通

游戏厂商有时会限制数据互通，导致用户更换系统后需要重新注册账号，并可能增加消费。分开运营可以更好地控制用户数据，避免数据同步问题。

市场策略

通过分系统运营，游戏开发者可以更精准地针对不同平台的用户群体设计营销活动和商业模式。例如，iOS用户可能更愿意为游戏内购买付费，而安卓用户可能更倾向于免费游戏加内购的商业模式。

系统差异

苹果和安卓在操作系统、API和开发工具等方面存在差异，这些差异可能导致开发者在优化和特性实现上做出不同的选择。分开运营可以更好地适应不同平台的技术要求。

用户体验

由于硬件和操作系统优化的差异，同一游戏在iOS和安卓上的性能可能有所不同。分服务器可以确保每个平台的玩家都能获得最佳的游戏体验。

防止不公平游戏竞争

分服务器可以防止一些玩家通过非正当手段获得优势，比如使用外挂等作弊工具，从而保证游戏的公平性。

综上所述，手游分系统的主要原因是为了利益最大化、适应不同平台的审核和更新机制、控制用户数据、制定精准的市场策略、优化用户体验以及防止不公平游戏竞争。尽管这些做法可能会给消费者带来不便，但从商业角度来看，游戏开发者认为分开运营是有利的。