手机更新后文件消失可能有以下几种原因：

自动格式化系统盘：

一些手机在更新系统时会自动格式化系统盘，导致文件丢失。因此，在更新前务必备份重要文件。

软件冲突或版本过旧：

系统更新过程中可能会出现软件冲突或版本过旧的问题，导致系统文件被误删或损坏。

硬件故障：

手机突然死机或断电可能导致文件系统出错，进而引发文件丢失或损坏。

存储空间不足：

如果手机存储空间不足，更新时可能会自动删除一些文件以释放空间。

更新过程中的错误：

系统更新过程中可能出现错误，导致文件丢失或损坏。

建议的解决步骤：

检查备份：

如果你有定期备份文件的习惯，可以通过备份找回丢失的文件。

重启手机：

有时候重启手机可以解决一些临时性的问题，恢复丢失的文件。

检查权限设置：

确保所有需要访问文件的应用程序都获得了应有的权限。

使用数据恢复软件：

如果以上方法都无法找回文件，可以尝试使用数据恢复软件，如EasyRecovery等，来恢复丢失的数据。

避免自动更新：

如果你担心更新后文件会丢失，可以考虑关闭自动更新功能，手动进行系统更新，并在更新前备份重要文件。

检查存储卡：

如果文件存储在内存卡上，确保内存卡没有损坏，并尝试使用电脑恢复内存卡上的数据。

通过以上步骤，你应该能够找到并解决手机更新后文件丢失的问题。