清理iPhone 6s手机垃圾的方法如下：

使用系统自带的清理功能

重启手机：对于不越狱的iPhone 6s，重启手机是最简单的方法，可以释放一些缓存和临时文件。

清除浏览数据：进入“设置” > “Safari” > “清除历史记录与网站数据”，清空上网缓存。

管理存储空间：进入“设置” > “通用” > “存储空间与iCloud用量”，查看和管理各个应用的存储空间使用情况，删除不常用的应用和缓存。

使用第三方清理工具

腾讯手机管家：对于越狱的iPhone 6s，可以使用腾讯手机管家的内存清理功能，进行垃圾扫描和深度清理。

360优化大师：安装360优化大师，可以智能清理系统垃圾，强制性删除和卸载软件，并进行软件搬家。

Cleaner Pro：考虑使用第三方清理工具，如Cleaner Pro，这些工具通常能提供更全面的清理选项。

手动清理缓存

单个应用清理：进入某个应用的设置，找到清理缓存的选项进行清理。

后台程序管理：连续按下二次“主屏Home”返回按键，打开后台多任务管理，关闭不常用的后台应用程序。

其他建议

删除大文件和应用：定期检查并删除不再使用的应用，特别是那些占用空间大的应用。

清理相册：定期清理相册中的“最近删除”文件夹，释放存储空间。

使用电脑辅助清理：如果需要更彻底的清理，可以连接电脑使用爱思助手等工具进行清理。

通过以上方法，可以有效地清理iPhone 6s手机中的垃圾文件，释放存储空间，提升手机性能。