手机判断导航拥堵主要通过以下几种方式：

交通大数据分析

手机导航软件会收集用户的实时位置、行驶方向、行驶速度等数据，并将这些数据上传到后台服务器。服务器通过分析大量用户的数据，能够精准判断路况状况。例如，当某段路上的车辆行驶速度突然降低，且车辆密度明显增加时，系统就会判定该路段出现拥堵。

与交管部门合作

部分导航系统会从交管部门获取实时道路拥堵情况。这些数据可能包括车流量、事故信息等，帮助导航软件更准确地判断路况。

用户上报信息

导航使用者可以通过手机应用上报道路拥堵情况，系统会将这些信息汇总并显示在地图上。这种方式可以补充大数据分析的不足，提供更及时的路况信息。

GPS定位和行车数据

导航设备会将定位和行车数据传送到后台服务器，通过云计算进行分析处理，从而获取实时的拥堵情况。导航系统还可以通过与导航卫星合作确定位置信息，进一步分析路况。

历史数据分析

导航软件会利用历史大数据进行分析，预测相同时段和路段的路况。这种方法可以在路况没有实质性改变的情况下，提供较为准确的预测。

信号灯变化规律

导航系统可以通过记录多个车辆通过同一个路口的时刻，分析得出该路口信号灯的变化规律，从而精确到秒级别地预测信号灯的变化时间。

通过以上几种方式，手机导航软件能够实时、准确地判断道路拥堵情况，并以不同颜色（绿色代表畅通，黄色代表缓行，红色代表拥堵）在地图上显示，帮助用户提前规划最佳路线，避开拥堵路段，节省出行时间。