机关单位对手机进行检查的方式主要有以下几种：

手机探测门

技术原理：手机探测门采用微留残探技术，结合电磁涡流检测和自适应识别技术，能够准确分辨出被检测人员是否携带任何状态下的手机、数码相机、移动硬盘、平板电脑、录音笔、MP3、MP4等涉密电子产品。

使用方式：被检测人员以正常的姿势和速度通过手机探测门，即可完成违禁物品的报警。该设备通常安装在涉密区域的入口处，实现手机类电子产品的检查，从源头防止手机带入，切断机密信息泄露的途径。

手持探测器与人工手检相结合

传统方法：采用手持探测器与人工手检相结合的方式，但存在速度慢、漏报、安检工作强度大等问题。

技术侦查措施

法律依据：根据《公安机关办理刑事案件程序规定》，公安机关在立案后，根据侦查犯罪的需要，可以采取技术侦查措施。

检查条件：检查手机需要满足特定条件，如涉嫌犯罪的缘由、出示正式的工作证和县级权利机关的检查证等。

建议

选择合适的设备：机关单位应根据实际需求选择合适的手机探测门或其他安检设备，确保能够有效检测涉密电子产品。

遵守法律规定：在检查手机时，必须遵守相关法律法规，确保检查的合法性和正当性。

提高安检效率：采用手机探测门等先进技术，提高安检效率，降低安检工作人员的工作强度。

通过以上方式，机关单位可以有效地对手机进行检查，确保信息安全。